菌落计数是微生物实验中普遍的实验之一，菌落计数器利用图像采集器采集图像,通过计算机对图像进行分析,自动计数和测量细菌在固体培养基上生长而形成的肉眼可见的菌落或菌斑，是统计物品含菌数的有效方法，广泛用于食品、饮料、药品、生物制品、化妆品、卫生用品、饮用水、生活污水、工业废水、临床标本中细菌数的检验。
菌落计数器的使用：
1、将电源插头插入220伏电源插座内。
2、将计数笔插头插入仪器上的插孔内。
3、将电源开关拨向“开”，计数池内灯亮，同时数字显示应为“000”，表示允许进行计数。如数字不为“000”，应按复零键
4、将待检的培养皿(皿底朝上)，放入计数池内。
5、用计数笔在培养皿底面对所有的菌落逐个点数。每个数一个应听到“嘟”声才说明有效，否则应重点。此时，点到的菌落被标上颜色，显示数字自动累加。
6、用放大镜仔细检查，确认点数无遗漏，计数即已完毕。
7、显示的数字即为该培养皿内的菌落数。
8、记录数字后取出培养皿。按复“0”键，显示恢复“000”，为另一培养皿的计数作好准备。
菌落计数器的注意事项：
1、仪器应放置在平整牢固的实验台上使用。
2、点数菌落时，计数笔不要过于倾斜，轻轻点下至有弹跳感，听到“嘟”声即可，如点按过重，易损坏计数笔。
3、仪器应防潮、防剧烈震动、防直接日光暴晒、防酸碱侵蚀，用后应加防尘罩。
4、注意防止细菌污染计数池。
5、如仪器发生不计数的问题，可按检验键。如计数，说明计数笔坏。如仍不计数，说明仪器本身有问题，若发现故障，请不要随意拆卸，应请有经验的技术人员检修。
菌落计数器的作用：
食品杀菌技术近几年来逐渐被食品企业认可的一种方式。该技术在工人工作的同时，可以同步对空间空气杀菌，对人体没有任何伤害。
使得经高温后基本无菌的食品半成品，流转至冷却、挑选、包装及灌装等环节时，有效降低或避免这些空气中含有的微生物附着在食品表面，再次污染食品，有效提高车间空气和食品卫生质量。
极大的避免了休闲食品企业在检测中出现菌落总数超标的现象。另外菌落计数器在这一技术中起到了非常重要的作用，菌落计数器可以把菌种放大2倍以上，以避免人为的失误。
菌落计数器是一种数字显示式自动细菌检验仪器。由计数器、探笔、计数池等部分组成，计数器采用CMOS集成电路精心设计，LED数码管显示，字高13mm，清晰明亮，配合专用探笔，计数灵敏准确。黑色背景式记数池内，荧光灯照明，菌落对比清楚，便于观察。
